中华猕猴桃WOX转录因子的生物信息学分析

• 作者: 付春 黄春莉 江纳 杨瑶君
• 来源期刊: 广西植物
• 关键词: 中华猕猴桃 WOX 转录因子 基因家族 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2021,（9）
• 所属期刊栏目: 生理与分子生物学|Physiology and Molecular Biology
• 页码范围: 1561-1575
• 页数: 15页
• 分类号: Q943.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw202001027

摘要

WOX基因家族是植物特有的一类转录因子,在植物发育关键时期,如胚的形成、维持干细胞稳定性和器官形成过程中发挥重要调控作用.为探究WOX转录因子调控中华猕猴桃的生长发育的分子理论基础,该文利用ProtParam、Cell-PLoc2.0、SignalP4.1 Server等在线软件对中华猕猴桃的16个WOX转录因子进行理化特性、亚细胞定位和信号肽等详细的生物信息学分析.结果表明:(1)中华猕猴WOX转录因子的所有蛋白成员的氨基酸数目在138～371之间,分子量为16.222～42.185 kD,均定位于细胞核的不稳定亲水蛋白.(2)中华猕猴桃的16个WOX蛋白成员均属于Homodomain超家族,仅Achn362451是分泌蛋白,且仅Achn362451和Achn141001具有跨膜区.(3)大部分WOX蛋白成员的潜在磷酸化位点都位于丝氨酸处.(4)其二级结构主要以无规则卷曲为主,其次为α-螺旋.(5)保守基序分析结果表明中华猕猴桃的16个WOX蛋白成员均含有motif1.(6)系统进化分析结果表明中华猕猴桃与菠萝的亲缘关系最近,与番茄的亲缘关系最远.(7)在中华猕猴桃果实成熟过程中不同时期的转录组分析结果表明其WOX基因家族中4个成员Achn131681、Achn145561、Achn336591、Achn362451基因在授粉后20、120、127 d表达含量都较高,其他12个WOX基因成员表达含量低甚至不表达.该研究为进一步研究中华猕猴桃WOX转录因子在其生长发育过程中的分子机理提供了一定的参考依据.