沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析

• 作者: 杨艳北 许晶 李袁飞 贡继尚 饶友生
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 关键词: 沼泽红假单胞菌 LuxR 生物信息学 生物被膜
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 40-45
• 页数: 6页
• 分类号: S188
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2021.06.006

摘要

LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统,从而影响细菌生物被膜的形成.利用在线生物信息学预测软件,分析LuxR家族调控蛋白序列,对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构域和功能结构域进行分析和预测,为后续研究生物被膜形成机制奠定基础,也为生物被膜增强剂的开发提供新的思路.结果表明:LuxR家族调控蛋白为不稳定的亲水性蛋白;定位在细菌的细胞质中;无信号肽结构,推断其为非分泌性蛋白;二级结构中含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲等结构元件;α-螺旋和无规则卷曲对三级结构的稳定和功能发挥具有重要意义;含有5个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点包括第79位、第165位和第171位氨基酸,其中苏氨酸磷酸化位点包括第90位和第211位氨基酸;无跨膜结构域,推测LuxR家族调控蛋白不属于跨膜蛋白;LuxR家族调控蛋白参与细菌群体感应系统,含有2个保守结构域,分别为Autoind_bind和HTH_LUXR,该蛋白通过这2个保守结构域起到转录调控的作用.