大豆胞囊线虫相关G2-like转录因子生物信息学分析

• 作者: 韩英鹏 李一 吴桐 徐爱佟 白芮瑶 卜凡珊 姜海鹏
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 G2-like 转录因子 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2022,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告|Research Report
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9369.2022.03.001

摘要

G2-like转录因子在植物中广泛存在,是GARP转录因子超家族中重要成员之一,在叶绿体发育、果实生长、生物或非生物胁迫和植物衰老等方面均起重要作用.研究对大豆胞囊线虫3号生理小种胁迫下东农L-10(抗病)根部进行转录组测序,初步筛选得到8个与大豆胞囊线虫抗性相关G2-like转录因子,并通过在线软件对其作生物信息学分析.结果表明,G2-like家族成员中8个G2-like转录因子均定位于细胞核,为亲水性蛋白;蛋白质二级结构大多以无规则卷曲为主;GlGLK-3含有与大豆生长发育及逆境胁迫密切相关顺式作用元件.GlGLK-1、GlGLK-2、GlGLK-5和GlGLK-7与拟南芥ATGLK1和ATGLK2亲缘关系最近,预示其在功能上相似性.