缺铁水稻根转录本微点阵分析

• 作者: 印莉萍 孙彤 闫莉婕 黄勤妮
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: 微点阵,转录本组图谱 缺铁胁迫,水稻根
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: S511
• 字数: 3928字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2004.03.001

摘要

水稻不仅是非常重要的粮食作物,也是用于研究的模式植物之一. 由于水稻基因组测序的完成,用功能基因组学的现代方法来研究缺铁相关基因的表达调控是最高效的方法之一. 在前期工作的基础上,精心设计了缺铁和EDTA鳌合二价铁诱导5天的水稻根实验,并进行了转录水平的微点阵(microarray)分析.但只获得了第5天的结果. 在10531个水稻cDNA芯片图谱中,缺铁和加铁比较发现了451个差异点.对缺铁诱导的451个差异cDNA逐一地进行NCBI (美国国家生物技术信息中心)的BLAST(局部定位排列搜索工具)数据库检索、分析和归类.发现其中缺铁与加铁(-Fe/Fe-EDTA ratio)之间的相对表达水平(REL) 在2-9.175之间的缺铁诱导上调基因为203个,缺铁诱导的下调基因为248个.对每一类上调基因都逐一地进行了NCBI-PubMed 的文献检索.利用国际网络数据库进行了功能鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙彤	首都师范大学生物系	7	41	3.0	6.0
2	印莉萍	首都师范大学生物系	66	896	17.0	27.0
3	黄勤妮	首都师范大学生物系	32	407	14.0	19.0
4	闫莉婕	首都师范大学生物系	3	17	2.0	3.0