华支睾吸虫成虫全长基因表达文库的构建和基因表达谱的建立

• 作者: 余新炳 吴忠道 应康 徐劲 胡旭初 谢毅 陈守义
• 来源期刊: 中国人兽共患病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 华支睾吸虫 基因表达谱 生物信息学
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 383-386,393
• 页数: 5页
• 分类号: R382.2
• 字数: 4426字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2004.05.006

摘要

目的获得尽可能多的华支睾吸虫UNIGENE及全长基因,建立成虫基因表达谱,为华支睾吸虫发育过程中基因表达的规律和功能基因组学研究奠定基础.方法构建pBluescript Ⅱ SK全长cDNA质粒文库,先对5'端进行随机EST大量测序,生物信息分析后归并UNIGENE,并对归并的结果进行了3'端的序列测定,根据3' 端测序结果,再次进行UNIGENE归并,对能够拼接上的克隆进行了序列拼接.对预测为完整基因且未测通的序列,进行了引物设计,walking反应测序,将得到的UNIGENE用点样法制备基因芯片.结果获得5'端有效EST序列4066个,测序结果UNIGENE分析,归并获得1775个UNIGENE,5'端预测的全长基因为377个.共获得测通的cDNA序列277个,其中全长基因198个.目前制备的华支睾成虫基因表达谱芯片含有1775个基因.结论所构建的华支睾吸虫成虫全长cDNA文库质量较好,采用的技术路线获取全长基因建立基因表达谱的效率较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢毅	复旦大学生命科学院遗传学研究所	112	843	16.0	24.0
2	余新炳	中山大学基础医学院寄生虫学教研室	201	1352	17.0	28.0
3	吴忠道	中山大学基础医学院寄生虫学教研室	171	835	14.0	21.0
4	徐劲	中山大学基础医学院寄生虫学教研室	104	568	13.0	17.0
5	胡旭初	中山大学基础医学院寄生虫学教研室	108	574	13.0	17.0
6	陈守义	中山大学基础医学院寄生虫学教研室	31	211	8.0	13.0
7	应康	复旦大学生命科学院遗传学研究所	48	652	17.0	23.0