水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析

• 作者: 周其兴 徐勤民 薛庆中 谭军
• 来源期刊: 重庆工商大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻亚种 基因组 微卫星 多态性 分子进化
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 生物与食品科学
• 页码范围: 16-21
• 页数: 6页
• 分类号: S530
• 字数: 5173字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-058X.2007.01.006

摘要

从公布的水稻两个亚种(籼稻9311和粳稻Nipponbare)基因组草图序列中,搜寻了所有的完整微卫星位点,发现单碱基重复中A/T重复占大多数,二碱基重复中AT/TA、GA/TC、AG/CT重复居多,三碱基中GGC/GCC、GCG/CGC、CCG/CGG重复较多.通过相互比较,不同基序和基因区域的微卫星多态性有较大差异:内含子和基因间区中微卫星的多态性较高(分别约为45%和40%),外显子中的微卫星多为三碱基重复,而且多态性较低(约为25%);两个亚种具多态性的微卫星间距平均约为12.7 kb和16.4 kb.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛庆中	浙江大学农业与生物技术学院	86	2472	28.0	47.0
2	谭军	重庆邮电大学生物信息研究所	13	316	5.0	13.0
3	徐勤民	重庆邮电大学生物信息研究所	1	2	1.0	1.0
4	周其兴	大连大学生物工程学院	4	34	3.0	4.0