橡胶树EST-SSR标记的开发与应用

• 作者: 安泽伟 李维国 程汉 赵彦宏 黄华孙
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 橡胶树 SSR EST
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 311-319
• 页数: 9页
• 分类号: S7
• 字数: 5017字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2009.00311

摘要

通过对橡胶树10778条EST序列进行拼接,共得到Unigene 3090条,从中发掘出分布于353条Unigene的430个EST-SSR位点,SSR发生频率为11.42%,平均分布距离为3.93 kb.在橡胶树EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占63.49%,32.09%.TC/AG、CT/GA和CTT/GAA、AAG/TTC、AGA/TCT是二、三核苷酸的优势重复类型.利用PRIMER5.0设计引物148对,随机挑选21对引物进行合成,并用其中15对扩增较好的引物,通过变性聚丙烯酰胺凝胶结合银染的方法对44个橡胶树无性系进行了遗传多样性检测,构建了聚类分析树状图.研究结果表明,从橡胶树EST中开发SSR标记是有效、可行的,文章所开发的EST-SSR引物可用于橡胶树遗传分析研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李维国	中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心	53	420	9.0	17.0
2	黄华孙	中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心	72	505	11.0	19.0
3	安泽伟	中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心	18	201	7.0	14.0
4	赵彦宏	鲁东大学生命科学院	32	336	9.0	17.0
5	程汉	中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心	17	177	6.0	13.0