IFITM1克隆测序及生物信息学分析

• 作者: 刘宇虎 张振书 杨兴龙 柳娟 肖冰 郭文英 钟东
• 来源期刊: 医学研究杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结直肠癌 干扰素诱导的跨膜蛋白-1(IFITM1) 基因克隆 序列分析 生物信息
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 40-43,138
• 页数: 5页
• 分类号: R3
• 字数: 2718字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-548X.2009.05.014

摘要

目的 研究干扰素诱导的跨膜蛋白-1基因(interferon induced transmembrane protein 1.IFITM1)克隆、测序,对序列进行分析,并获取生物学信息.方法 以IFITM1的cDNA为模板,用Pfu酶做PCR扩增,在EcoRⅠ和Hind Ⅲ双酶切后,将IFITM1的cDNA片段克隆到pUCm-T质粒,对重组的pUCm-T-IFITM1测序后,采用All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB Sequences Database 和 Simple Modular Architecture Research Tool (SMART)对IFITM1的cDNA进行生物信息学分析. 结果扩增后,含有IFITM1基因cDNA的PCR产物约1000 bp,IFITM1的 cDNA成功克隆到pUCm-T质粒并进行测序.序列分析结果显示,IFITM1结构cDNA全长683bp, 有2个外显子.IFITM1的 mRNA编码的氨基酸在37～57和87～107有2个跨膜区,编码125个氨基酸的多肽,其蛋白相对分子质量为14kDa.结论 IFITM1基因的成功扩增、克隆、测序,获取了IFITM1基因的cDNA、mRNA以及编码蛋白质氨基酸的生物学信息,有利于研究IFITM1基因与大肠癌的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张振书	南方医科大学南方医院消化病研究所	57	191	8.0	10.0
2	肖冰	南方医科大学南方医院消化病研究所	55	252	10.0	13.0
3	刘宇虎	广东省东莞市人民医院消化科	25	108	8.0	9.0
4	钟东	南方医科大学南方医院消化病研究所	5	38	4.0	5.0
5	柳娟	广东省东莞市人民医院消化科	9	71	6.0	8.0
6	郭文英	广东省东莞市人民医院消化科	2	14	2.0	2.0
7	杨兴龙	南方医科大学南方医院消化病研究所	2	3	1.0	1.0