哺乳动物锌指蛋白家族中KRAB功能域的进化

• 作者: 丁国徽 袁力赟 赵中明
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: KRAB功能域 锌指基因 亚家族 进化
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 页码范围: 202-206,211
• 页数: 6页
• 分类号: Q71
• 字数: 5044字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.03.010

摘要

KRAB锌指基因是哺乳动物中最大的转录调控因子家族, 它的多数成员在基因组上成簇分布,具有五种不同的亚家族,在功能行使上承担着不同的作用.本文通过对人类、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗五种哺乳动物全蛋白质组序列及mRNA组织表达谱分析,验证了C2H2锌指结构在单个KRAB蛋白质中出现的数目多于一般锌指蛋白质;KRAB功能域在各物种中分布显著不同且与分化时间不成正比,这表明KRAB相关功能域多样性在灵长类进化过程中潜在的适应性进化.同时,提出KRAB亚家族进化的路线:即KRAB-Aa为起始家族,Ba由Aa直接演变形成,而Ca,blonga和XRCC三种亚型可能经过Ba或直接从Aa演变形成;此外,锌指结构在单个蛋白质中出现个数伴随KRAB功能域自身的进化路线逐渐递增,反映了KRAB功能域在形成新转录调控因子方面的积极作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁力赟	上海交通大学生命科学技术学院	1	0	0.0	0.0
2	丁国徽	中国科学院系统生物学重点实验室	1	0	0.0	0.0