生物软件在序列分析过程中的运用

• 作者: 巴恒星 李志鹏 杨福合 章秀婷 邵西群
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物序列 检索 分析 软件
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 321-324,329
• 分类号: Q31
• 字数: 3498字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.04.009

摘要

介绍了组合使用BLAST、FASTA /BLAST Scan3.2,或用多序列比对软件,从数据库中快速提取大数量目标序列,最后用MEGA4快捷编辑整理大数量序列的方法.还介绍了一种生成核酸序列与其氨基酸序列相似性百分率整合表格的方法.简述了对引物设计的基本认识并介绍了多重引物兼容性筛选软件;对构建系统发育树的认识并引出分子进化树构建软件MEGA4的使用和PAUP 4.0常用建树命令模块.期望这些方法和软件的使用能解决生物序列分析过程的常见问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵西群	中国农业科学院特产研究所	19	49	5.0	6.0
2	巴恒星	中国农业科学院特产研究所	6	14	3.0	3.0
3	李志鹏	中国农业科学院特产研究所	10	23	3.0	4.0
4	章秀婷	中国农业科学院特产研究所	7	19	2.0	4.0
5	杨福合	中国农业科学院特产研究所	115	657	14.0	18.0