鸭肠炎病毒核衣壳蛋白密码子偏爱性分析

• 作者: 代淑燕 周碧君 张荷 文明 程振涛 高颖
• 来源期刊: 山地农业生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭肠炎病毒 核衣壳蛋白 密码子偏爱性
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 136-140
• 分类号: Q755|S945.4
• 字数: 2240字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0457.2011.02.009

摘要

为给鸭肠炎病毒(DEV)核衣壳蛋白(NP)基因选择良好的宿主表达系统提供参考依据,本研究运用EMBOSS软件包CHIPS和CUSP程序对DEV NP基因进行了密码子偏爱性分析.结果显示,DEV NP基因的ENC值为51.180,编码NP蛋白的A、I等氨基酸不同密码子的使用频率存在一定的差异;从与DEV NP基因密码子使用频率比值上看,大肠杆菌22个、酵母18个、鸭12个和人20个密码子存在较大的偏爱性.由此可见,编码DEV NP蛋白密码子出现频率较均一,且酵母等真核生物与其密码子偏爱性较为接近,可作为该基因体外表达宿主的首选.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周碧君	贵州大学动物科学学院	218	1054	13.0	22.0
3	文明	贵州大学动物科学学院	219	646	10.0	14.0
5	程振涛	贵州大学动物科学学院	111	378	10.0	14.0
13	高颖	贵州大学动物科学学院	9	17	3.0	4.0
14	张荷	贵州大学动物科学学院	5	7	2.0	2.0
15	代淑燕	贵州大学动物科学学院	5	24	3.0	4.0