积壳EST-SSR标记的开发

• 作者: 叶金山 朱培林 杨春霞 温强
• 来源期刊: 分子植物育种
• 学科: 农学
• 关键词: 枳壳 表达序列标签(EST) 简单重复序列(SSR)
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 123-127
• 分类号: S5
• 字数: 3745字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/mpb.009.000123

摘要

GenBank上己公布的积壳EST序列为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源.本研究利用在线SSR鉴定软件SSRIT分析来自积壳EST数据库的11029条Unigene序列.分析结果共发现327条EST序列含有348个SSR位点,占总数的2.96%.其中,三核苷酸重复的SSR类型最多,共有161个,占检索总数的46.26%. Primer 3.0设计合成58对EST-SSR引物,其中36对能扩增出产物,6对引物产生多态性分离,分别占所设计引物总数的62.07%和10.34%.本文研究成果为今后积壳遗传多样性分析、遗传图谱构建及比较基因组等研究方面奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶金山		54	652	15.0	23.0
2	温强		31	427	11.0	19.0
3	杨春霞		24	147	6.0	11.0
4	朱培林		64	384	11.0	16.0