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麻竹EST-SSR标记开发及其对慈竹变异类型的分析研究
麻竹EST-SSR标记开发及其对慈竹变异类型的分析研究
作者:
刘青
李彩丽
杨丽
高志民
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
麻竹
EST-SSR
分子标记
慈竹
栽培变异类型
遗传距离
摘要:
利用麻竹(Dendrocalamus latiflorus)已有的EST序列,开发了一批EST-SSR分子标记,并用于慈竹(Bambusa emeiensis)栽培变异类型的多态性研究.结果表明,在麻竹9574个EST中找到了331个EST,含有381个SSR位点,SSR 出现的频率为3.98%.EST-SSR的重复类型共有59个,其中2个核苷酸的重复最多,占63.8%,其次是3个核苷酸的重复序列.根据含有SSR的EST序列设计出了44对引物,对慈竹及其变异类型进行了扩增效率、多态性及通用性检测,其中37对引物能够扩增出稳定且清晰的条带,且扩增具有多态性,扩增片段长度主要集中在100~1000 bp,引物有效率达84.1%.遗传相似性分析结果显示,所检测样品间遗传距离为0.263~0.840,平均为0.552,其中‘黑笋慈竹’与‘琴丝慈竹’、‘蛇头慈竹’与‘龙头慈竹’之间的遗传距离较近,而‘罗汉慈竹’与其他样品的遗传距离最远.
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桑树
EST-SSR
引物
开发
EST数据库
多态性
内容分析
文献信息
引文网络
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期刊文献
内容分析
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关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
麻竹EST-SSR标记开发及其对慈竹变异类型的分析研究
来源期刊
热带亚热带植物学报
学科
农学
关键词
麻竹
EST-SSR
分子标记
慈竹
栽培变异类型
遗传距离
年,卷(期)
2012,(5)
所属期刊栏目
植物生理与分子生物学
研究方向
页码范围
462-468
页数
分类号
S795
字数
4330字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1005-3395.2012.05.006
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
高志民
国际竹藤中心竹藤科学与技术重点开放实验室
76
679
15.0
21.0
2
刘青
国际竹藤中心竹藤科学与技术重点开放实验室
6
45
4.0
6.0
3
杨丽
国际竹藤中心竹藤科学与技术重点开放实验室
7
56
4.0
7.0
4
李彩丽
国际竹藤中心竹藤科学与技术重点开放实验室
2
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2.0
传播情况
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2020(4)
引证文献(1)
二级引证文献(3)
研究主题发展历程
节点文献
麻竹
EST-SSR
分子标记
慈竹
栽培变异类型
遗传距离
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
热带亚热带植物学报
主办单位:
中国科学院华南植物园
广东省植物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1005-3395
CN:
44-1374/Q
开本:
大16开
出版地:
广州天河区兴科路723号中国科学院华南植物园
邮发代号:
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
2032
总下载数(次)
6
总被引数(次)
31320
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热带亚热带植物学报2012年第2期
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