麻竹EST-SSR标记开发及其对慈竹变异类型的分析研究

• 作者: 刘青 李彩丽 杨丽 高志民
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 麻竹 EST-SSR 分子标记 慈竹 栽培变异类型 遗传距离
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 462-468
• 分类号: S795
• 字数: 4330字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2012.05.006

摘要

利用麻竹(Dendrocalamus latiflorus)已有的EST序列,开发了一批EST-SSR分子标记,并用于慈竹(Bambusa emeiensis)栽培变异类型的多态性研究.结果表明,在麻竹9574个EST中找到了331个EST,含有381个SSR位点,SSR 出现的频率为3.98％.EST-SSR的重复类型共有59个,其中2个核苷酸的重复最多,占63.8％,其次是3个核苷酸的重复序列.根据含有SSR的EST序列设计出了44对引物,对慈竹及其变异类型进行了扩增效率、多态性及通用性检测,其中37对引物能够扩增出稳定且清晰的条带,且扩增具有多态性,扩增片段长度主要集中在100～1000 bp,引物有效率达84.1％.遗传相似性分析结果显示,所检测样品间遗传距离为0.263～0.840,平均为0.552,其中‘黑笋慈竹’与‘琴丝慈竹’、‘蛇头慈竹’与‘龙头慈竹’之间的遗传距离较近,而‘罗汉慈竹’与其他样品的遗传距离最远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高志民	国际竹藤中心竹藤科学与技术重点开放实验室	76	679	15.0	21.0
2	刘青	国际竹藤中心竹藤科学与技术重点开放实验室	6	45	4.0	6.0
3	杨丽	国际竹藤中心竹藤科学与技术重点开放实验室	7	56	4.0	7.0
4	李彩丽	国际竹藤中心竹藤科学与技术重点开放实验室	2	11	1.0	2.0