小麦长链非编码RNA的预测及功能分析

• 作者: 张晶红 束永俊 王明波 王晓萍 郭东林 郭长虹
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 小麦 长链非编码RNA 全长cDNA 微小RNA
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 153-157
• 页数: 5页
• 分类号: Q518.2
• 字数: 2281字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.02.15

摘要

生物体有部分基因被转录成RNA,但是不编码相应蛋白质,称为长链非编码RNA(IncRNA).它们参与基因的表观调控,这一过程对动物、植物的生长发育都有重要作用,但是,目前植物中发现和研究的IncRNA较少.为了研究lncRNA在植物中的功能,本研究建立了基于小麦全长cDNA的IncRNA识别程序.从6162条小麦全长cDNA中发现了231条IncRNAs,并从中鉴定出两个新miRNAs,这表明IncRNAs可以通过形成miRNAs前体基因形成其功能.此外,通过序列富集分析,我们从小麦IncRNAs中鉴定出三个保守的调控元件,结果显示小麦IncRNAs可能通过和其它蛋白质或DNA等分子作用,进而参与小麦生长、发育等过程的调控,这些结果对进一步研究植物体内的IncRNA的功能和作用机制具有重要意义.