高通量DNA甲基化数据的处理和分析方法

• 作者: 刘洪波 张岩 王心宇 王芳 苏建忠 许颖出
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 地球科学
• 关键词: DNA甲基化 高通量 二代测序 BS-Seq
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 72-76
• 页数: 5页
• 分类号: N37
• 字数: 3739字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2014.01.12

摘要

DNA甲基化作为一种表观遗传学修饰,在调控基因表达、X染色体失活、印记基因等方面都发挥着重要的作用.不同的DNA甲基化的预处理方法结合二代测序产生了大量的高通量甲基化数据,这些数据的存储、处理和分析是当前亟需解决的问题.在本文中,总结了目前存在的三种高通量DNA甲基化检测技术(限制性内切酶法,亲和纯化法,重亚硫酸盐转换法),以及针对这些技术产生的高通量数据开发的存储、处理和分析工具.另外,还注重介绍了单碱基水平的DNA甲基化检测技术,BS-Seq的测序原理、数据处理流程以及后续的分析工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张岩	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	51	157	6.0	9.0
2	王心宇	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	4	39	3.0	4.0
3	王芳	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	34	139	6.0	11.0
4	刘洪波	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	10	25	3.0	4.0
5	苏建忠	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	12	32	4.0	4.0
6	许颖出	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	1	7	1.0	1.0