生物信息学预测hsa-miR-186的靶基因与功能

• 作者: 吴嘉 宋佳希 汪俊军 袁云龙
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 微小核糖核酸 hsa-miR-186 生物信息学 靶基因 功能
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 基础实验诊断研究
• 页码范围: 765-770
• 页数: 6页
• 分类号: Q752
• 字数: 4252字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2014.10.14

摘要

目的 利用生物信息学的方法预测hsa-miR-186的靶基因与功能,为深入研究其生物学功能提供理论依据.方法 利用Pubmed检索miR-186相关文章,进行总结分析;用miRbase、NCBI等在线工具分析hsa-miR-186序列及所在基因组特征;用TargetScan、PicTar及miRanda预测hsa-miR-186的靶基因,结合已证实的靶基因进行功能富集分析(GO analysis)和信号转导通路富集分析(Pathway analysis).结果 已有的研究证实miR-186与多种肿瘤发生、发展有关;参与压力应激引起的神经功能改变,并在心血管疾病中表达异常.hsa-miR-186位于人类染色体1p31.1,序列具有高度保守性.hsa-miR-186靶基因功能富集在糖代谢、肾脏发育、视觉功能、神经功能、脂质转运等生物学过程;信号通路涉及前列腺癌、肿瘤信号通路、p53信号通路、黑色素瘤、细胞黏附分子和细胞周期等信号通路.结论 hsa-miR-186功能广泛,与神经系统发育、细胞增殖与凋亡、糖代谢和脂质转运等密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋佳希	南京军区南京总医院解放军临床检验医学研究所	14	113	7.0	10.0
2	汪俊军	南京军区南京总医院解放军临床检验医学研究所	97	817	16.0	22.0
3	袁云龙	南京军区南京总医院解放军临床检验医学研究所	5	34	4.0	5.0
4	吴嘉	南京军区南京总医院解放军临床检验医学研究所	11	85	6.0	8.0