拟南芥转录因子CBF2的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘爱平 毛娟 申鹏 陈佰鸿
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 转录因子 CBF2 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 园艺—研究报告
• 页码范围: 90-95
• 分类号: Q785
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在克隆转录因子CBF2并对其进行生物信息学分析得到该基因相关信息.试验以拟南芥基因组DNA为模板,根据GenBank中拟南芥转录因子CBF2(FJ491243.1)已知序列设计引物,回收扩增的目的片段与T-easy载体连接后转入大肠杆菌(E.coli DH5α),经蓝白斑筛选后提取重组体的质粒,经滞后筛选、PCR、酶切鉴定无误后进行测序.经生物信息学分析,该基因全长651 bp,其中编码区长648 bp,编码216个氨基酸,其蛋白的分子式为C1056H1623N293O333S16,相对分子质量为24.26 kDa,等电点为5.00,该蛋白为亲水性非分泌型蛋白,无信号肽存在;其蛋白质二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主.肽链可能含有9处丝氨酸磷酸化位点,6处苏氨酸磷酸化位点,以及2处酪氨酸磷酸化位点.本研究通过对CBF2基因的生物信息学分析,获得了该基因的相关信息,并与已有研究结果进行比对分析,推测该基因在植物抗逆过程中有重要的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈佰鸿	甘肃农业大学农学院	128	886	13.0	25.0
2	毛娟	甘肃农业大学农学院	91	429	10.0	18.0
3	申鹏	甘肃农业大学农学院	1	8	1.0	1.0
4	刘爱平	甘肃农业大学农学院	1	8	1.0	1.0