猪嵴病毒福建株结构蛋白VP基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 修金生 林群群 胡崇伟 陈晓珞 陈秋勇 陈鹏强
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪嵴病毒 结构蛋白VP 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（32）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医科学
• 页码范围: 10-14
• 分类号: S855.3
• 语种: 中文

摘要

为丰富猪嵴病毒结构的分子流行病学数据,明确福建株猪嵴病毒结构蛋白VP的特征,研究运用RT-PCR方法设计特异性引物,对猪嵴病毒结构蛋白进行分段扩增后进行克隆测序,并将测序结果进行拼接后进行生物信息学分析.结果表明,所扩增福建株猪嵴病毒含有完整的结构蛋白VP,其基因全长为2529 bp,编码有843个氨基酸,理论等电点为5.34,理论分子质量为89.603kD,不稳定系数为37.71,最大疏水指数为2.522,最小疏水指数为-2.622.其和XX株猪嵴病毒结构蛋白核苷酸同源性最高,仅为86.7％,与swine/S-1-HUN/2007/Hungary株猪嵴病毒结构蛋白核苷酸同源性最低,为83.7％.从遗传进化上看,猪嵴病毒结构蛋白在遗传进化上呈现2个独立的分支,中国猪嵴病毒分离株在2个遗传分支上均有分布.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡崇伟	福建农林大学动物科学学院	14	17	2.0	3.0
2	陈秋勇	福建农林大学动物科学学院	12	18	2.0	3.0
3	林群群	福建农林大学动物科学学院	10	11	2.0	2.0
4	陈鹏强	福建农林大学动物科学学院	10	13	2.0	2.0
5	修金生	福建农林大学动物科学学院	33	150	7.0	11.0
6	陈晓珞		2	1	1.0	1.0