动态加权蛋白质相互作用网络构建及其应用研究

• 作者: 李学勇 熊慧军 王晶 胡赛 赵碧海
• 来源期刊: 自动化学报
• 关键词: 动态加权网络 功能预测 蛋白质相互作用网络 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 论文与报告
• 页码范围: 1893-1900
• 页数: 8页
• 字数: 7005字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16383/j.aas.2015.c150211

摘要

一个蛋白质可能在不同条件或不同时刻与不同的蛋白质发生相互作用, 这称为蛋白质的动态特性. 蛋白质在分子处理的不同阶段参与到不同的模块, 与其他的蛋白质共同完成某项功能. 因此, 动态蛋白质相互作用的研究有助于提高蛋白质功能预测的准确率. 结合蛋白质相互作用网络和时间序列基因表达数据, 构建动态蛋白质相互作用网络. 为降低PPI 网络中假阴性对功能预测产生的负面影响, 结合结构域信息和复合物信息, 预测和产生新的相互作用, 并对相互作用加权. 基于构建的动态加权网络, 提出一种功能预测方法D-PIN (Dynamic protein interaction networks). 基于三个不同的酵母相互作用网络实验结果表明, D-PIN方法的综合性能比现有方法提高了14%以上. 结果验证了构建的动态加权蛋白质相互网络的有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	熊慧军	长沙学院数学与计算机科学系	7	23	3.0	4.0
2	胡赛	长沙学院数学与计算机科学系	10	29	4.0	5.0
3	赵碧海	长沙学院数学与计算机科学系	15	35	4.0	5.0
4	王晶	长沙学院数学与计算机科学系	11	34	3.0	5.0
5	李学勇	长沙学院数学与计算机科学系	6	35	5.0	5.0