利用生物信息学技术预测副溶血弧菌噬菌体VPp1内溶素基因及其裂解机制

• 作者: 孙翌 庄松娟 林洪 王静雪 金延秋
• 来源期刊: 中国渔业质量与标准
• 学科: 农学
• 关键词: 噬菌体 副溶血弧菌 内溶素 蛋白结构 生物信息分析
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 病害与渔药
• 页码范围: 67-71
• 页数: 5页
• 分类号: S94|Q75
• 字数: 2806字
• 语种: 中文

摘要

通过对副溶血弧菌噬菌体VPp1全基因组分析,利用相似性比对数据库BLAST和序列模体数据库,初步推定该基因组的ORF31编码内溶素,预测该开放式阅读框编码一种糖苷水解酶.预测内溶素不含信号肽、跨膜区域.从生物信息学角度推定噬菌体VPp1内溶素的裂解机制可能是联合孔蛋白协同作用裂解细菌肽聚糖.本研究为进一步揭示内溶素生物学特性提供基础数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林洪	中国海洋大学食品科学与工程学院	211	2069	22.0	32.0
2	王静雪	中国海洋大学食品科学与工程学院	35	225	9.0	13.0
3	庄松娟		3	17	2.0	3.0
4	孙翌		4	17	2.0	4.0
5	金延秋	中国海洋大学食品科学与工程学院	1	1	1.0	1.0