基于越橘果实转录组测序WBC型转运蛋白基因发掘及表达分析

• 作者: 刘禹姗 刘红弟 孙海悦 康立敏 汪立宇 王静 盖钰卓 耿金曼 陈丽
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 越橘 WBC型转运蛋白 荧光定量PCR 表达分析
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: S663.9
• 字数: 6029字
• 语种: 中文

摘要

为发掘越橘中WBC型(White brown complex)ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporters)基因,研究其与次生代谢物质(Secondary metabolite)运输关系,从越橘果实转录组测序文库中筛选出21个编码WBC型转运蛋白基因.其中10个基因上调表达,11个基因下调表达,10个上调表达基因中有7个基因显著上调表达.以越橘‘北陆’(Northland)根、茎、叶芽、叶、花芽、花、绿果、粉果、蓝果、蓝果种子、蓝果果皮和蓝果果肉为试验材料,对7个显著上调表达基因进行实时荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)分析,研究在越橘各个器官和果实发育不同阶段中表达模式.结果表明,越橘中7个WBC转运蛋白基因中有5个基因在果皮和果肉中的表达情况与转录组分析结果一致.越橘所有组织器官中均能检测到WBC型转运蛋白表达,但表达量不同.Unigene5067_All和Unigene27766_All在根中表达量最高,Unigene 14517_All、Unigene27928_All和Unigene29820_All分别在茎、花和蓝果中表达量最高,Unigene34381_All和Unigene34438_All表达量从绿果、粉果到蓝果呈递增表达模式,与越橘中花色素苷累积呈现一致性,推测这两个WBC转运蛋白基因可能参与越橘次生代谢物运输.有助于阐明越橘中WBC转运蛋白生理生化功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙海悦	吉林农业大学园艺学院	24	188	6.0	13.0
2	耿金曼	吉林农业大学园艺学院	4	10	3.0	3.0
3	刘禹姗	吉林农业大学园艺学院	5	14	3.0	3.0
4	王静	吉林农业大学园艺学院	8	27	3.0	5.0
5	盖钰卓	吉林农业大学园艺学院	6	14	3.0	3.0
6	康立敏	吉林农业大学园艺学院	3	14	3.0	3.0
7	陈丽	吉林农业大学园艺学院	15	160	5.0	12.0
8	刘红弟	吉林农业大学园艺学院	2	7	2.0	2.0
9	汪立宇	吉林农业大学园艺学院	1	3	1.0	1.0