5种蔷薇科树种多酚氧化酶比较基因组学分析

• 作者: 关军锋 孟钰玉 宋亚伟 李桂琴 王云松 闫洪波
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 蔷薇科 多酚氧化酶 基因倍增 基因进化
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 320-327
• 页数: 8页
• 分类号: S661|Q786
• 字数: 5314字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.02.021

摘要

蔷薇科植物中有多种具有重要价值的水果,如苹果、梨、桃、草莓和黑树莓等.这些水果普遍容易发生由多酚氧化酶(PPO)介导的酶促褐变而导致重大经济损失,从全基因组角度分析比较PPO基因家族,有助于加深对PPO基因家族和功能的认识.采用比较基因组学的方法,对这5种植物的PPO基因家族进行了基因鉴定、染色体定位、编码蛋白的亚细胞定位、内含子统计分析、基因系统进化、基因倍增与丢失等特征分析.从这5种植物中,共计鉴定出了42个PPO基因,其中6个基因被认定是假基因;绝大多数基因编码的蛋白定位于叶绿体,2个定位于线粒体,3个是分泌型蛋白;PPO基因在染色体上有串联重复和散布两种形式;9个基因具有内含子,聚类结果显示可以将它们分为6个类型,每个基因类型在进化过程中都发生过基因倍增和丢失;同型基因内含子的位置和大小具有相似性.这些结果揭示蔷薇科植物PPO基因内含子是伴随着基因倍增产生的,基因倍增也是推动PPO基因多样化的重要动力,PPO基因倍增和丢失差异导致PPO基因数量在不同物种之间产生差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李桂琴	河北经贸大学生物科学与工程学院	39	209	8.0	13.0
2	闫洪波	河北经贸大学生物科学与工程学院	22	51	4.0	5.0
3	关军锋	河北农林科学院遗传生理所	8	339	5.0	8.0
4	宋亚伟	河北经贸大学生物科学与工程学院	13	11	3.0	3.0
5	孟钰玉	河北经贸大学生物科学与工程学院	1	3	1.0	1.0
6	王云松	河北经贸大学生物科学与工程学院	1	3	1.0	1.0