建立TaqMan实时定量PCR检测SCN1A基因嵌合突变

• 作者: 吕建新 朱喆 朱萌华 李凯强 王震 蒋璐茜 郝珂 陈秉宇
• 来源期刊: 中国优生与遗传杂志
• 学科: 医学
• 关键词: TaqMan实时定量PCR 癫痫 婴儿严重肌阵挛性癫痫 Ⅰ型电压门控钠离子通道α亚基 嵌合突变
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 分子遗传学与生化遗传学
• 页码范围: 7-9,34
• 页数: 4页
• 分类号: R394.3
• 语种: 中文

摘要

目的 建立TaqMan实时定量PCR检测SCN1A基因嵌合突变的方法,调查婴儿严重肌阵挛癫痫(SMEI)家系的遗传背景.方法 抽提1例SMEI患儿及其父母的外周血全基因组DNA,对SCN1A基因外显子PCR扩增后直接测序检测突变位点.然后根据患儿所携带的c.302G＞A突变,合成突变型质粒、野生型质粒、TaqMan-MGB探针和引物.并以突变型及野生型质粒为研究对象,进一步分析方法的特异性及敏感度.最后用TaqMan实时定量PCR探寻其父母是否为SCN1A基因突变嵌合子.结果 建立的TaqMan实时定量PCR未发现非特异性扩增,且敏感度高,在107copies/ml的野生序列背景下能检测出1.6％的突变量.直接测序发现患儿存在SCN1A c.302G＞A杂合突变,父亲发现少量可疑突变背景,而母亲未发现.运用TaqMan实时定量PCR证实了患儿父亲含有c.302G＞A嵌合突变.结论 TaqMan实时定量PCR能有效提高SCN1A基因嵌合突变的检出率,对优生优育和遗传咨询有较大帮助.