四球茶转录组SSR位点信息分析

• 作者: 申铁 邢辉 黎瑞源
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 四球茶 转录组 SSR
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 茶与食品科学
• 页码范围: 558-562
• 页数: 5页
• 分类号: S571.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20170811.001

摘要

对基于高通量测序拼接获得的99 741条四球荼嫩叶Unigenes进行了SSR (simple sequence repeats)位点分析,共揭示了23 732个SSR位点,分布于18 552条Unigenes中,SSR发生频率为23.79％;含有SSR位点的Unigenes的总长度为226 188 bp,SSR位点间的平均距离为1/2.07 kb,重复长度平均长度为9.53 bp.在四球荼转录组SSR中,二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占总SSRs的47.53％和25.92％;在181种重复基元类型中,优势重复基元分别是AG/CT、A/T、ACC/GGT,分别占总SSRs的41.38％、22.10％和6.49％,共占总SSRs的比例达69.97％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢辉	贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室	6	15	3.0	3.0
2	黎瑞源	贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室	12	19	3.0	4.0
3	申铁	贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室	6	7	2.0	2.0