辣椒全基因组TCP转录因子家族生物信息学分析

• 作者: 冯羽娥
• 来源期刊: 种子科技
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 TCP 转录因子 全基因组分析
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 152-154
• 页数: 3页
• 分类号: S641.3
• 字数: 2580字
• 语种: 中文

摘要

利用生物信息学方法对辣椒TCP转录因子家族成员、基因分类、基因结构、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了预测和分析.结果表明,辣椒TCP基因家族包含30个成员,CaTCP蛋白含有95～550个氨基酸,等电点为6.30～10.91.进化树分析将其分为11个不同的亚族.辣椒TCP家族进化树以及基因结构的进一步分析,显示辣椒TCP家族可分为两大类,即Class Ⅰ类和Class Ⅱ类,而Class Ⅱ类可分为两个不同的亚类,即CIN和CYC/TB1亚类.位于同一亚家族的大多数TCP基因具有相似的内含子和外显子结构.此外,染色体定位分析表明,辣椒TCP基因不均衡的分布于辣椒的10条染色体上,其中3号染色体上最多,有7个.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯羽娥	西北农林科技大学园艺学院	1	2	1.0	1.0