一种基于均匀设计原理的自适应克隆选择分子对接构像搜索策略

• 作者: 刘燕茹 石继飞 罗利霞
• 来源期刊: 中国医学物理学杂志
• 关键词: 分子对接 构象搜索策略 均匀设计 自适应 克隆选择算法
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 医学生物物理
• 页码范围: 828-832
• 页数: 5页
• 分类号: TP306.1|R35
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-202X.2018.07.017

摘要

为提高分子对接精度与速度,设计且实现了基于均匀设计原理的自适应克隆选择自动分子对接搜索策略.该策略首先引入抗体浓度,用抗体浓度和最低结合自由能共同衡量抗体品质;并利用均匀设计原理设计了克隆选择算法各参数的组合式样;然后利用自适应的克隆增殖、自适应的变异以及自适应的重组算子替代了克隆选择、高频变异以及简单重组算子.为验证该对接方法的有效性,用此方法对布克海文蛋白质数据库中的6种蛋白质—配体复合物进行实验测试,并将实验结果与拉马克遗传算法、模拟退火算法、免疫遗传算法和简单克隆选择算法进行比较,实验表明该对接策略具有更快的收敛速度和更好的寻优能力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗利霞		29	63	5.0	7.0
2	石继飞		19	34	4.0	4.0
3	刘燕茹		25	37	4.0	4.0