基于高通量转录组测序的辣木叶粉对小鼠肝脏差异表达基因的影响

• 作者: 史崇颖 彭磊 戴天渑 曾寰宇 段胜常 田洋 盛军 解静 郝若诗
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 学科: 医学
• 关键词: 辣木叶粉 肝脏转录组 高通量RNA测序 差异表达基因 代谢通路
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 药材·园林园艺
• 页码范围: 456-467
• 页数: 12页
• 分类号: R966
• 字数: 6547字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).201706019

摘要

[目的]辣木(Moringa oleifera Lam.)是一种营养价值丰富的新型食品或饲料资源,但是食用或饲用辣木后对动物机体代谢的调控机制仍不清楚.[方法]18只小鼠随机分为2组,即辣木叶粉饲料组(50％MO)和基础饲料组(对照组).在饲料干预的第3、10和25天每组随机取3只小鼠进行解剖,采集肝脏组织样品,并利用高通量RNA-seq测序技术对小鼠肝脏进行RNA测序,使用TopHat v2.0.13软件将测序得到的reads序列与小鼠(GRCm38)参考基因组序列比对,计算表达量并鉴定差异表达基因,同时对差异表达基因参与的GO功能及代谢途径进行富集.[结果]从18个样本中共获得转录组数据约109.063 Gb,1 136 175 196条clean reads;与对照组相比,辣木叶粉饲料组表达上调和下调的差异表达基因共有1 227个;GO功能分类注释发现,第3、10和25天的差异基因都主要集中在细胞过程(cellular process)、细胞(cell)和结合(binding)3个过程;差异基因显著富集的KEGG代谢通路有37条fP＜0.05).[结论]辣木叶粉对小鼠肝脏中的过氧化物酶体、病毒性心肌炎和类固醇生物合成等代谢通路有一定影响.