麻竹笋转录组测序及苦涩味物质合成基因差异表达分析

• 作者: 丁兴萃 孙春娃 李露双 章志远 董文慧 蔡函江
• 来源期刊: 林业科学研究
• 关键词: 麻竹笋 避光 转录组测序 苦涩味物质 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 页码范围: 38-46
• 页数: 9页
• 分类号: S718.46|S795.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.04.006

摘要

[目的]研究避光处理对麻竹笋苦涩味物质合成相关基因表达的影响.[方法]利用Illumina HiSeq TM 2500平台对自然生长(CK)和覆土处理(EP)2种类型的麻竹笋进行转录组测序,并对差异表达基因进行分析.[结果]转录组测序共获得36.45 Gb原始数据,经组装去冗余处理得到53388个Unigene,将所得Unigene比对到Nr、Pfam、COG、Swissprot、GO和KEGG数据库中进行功能注释,发现共有31462条Unigene与其它物种的基因具有同源性.对CK和EP处理所测得的Unigene进行表达量的比较分析,筛选出1846个差异基因,其中,在EP处理中上调表达基因998个,下调表达基因848个.由KEGG代谢通路分析发现,差异基因显著地富集在32个代谢途径中,其中,包含与苦涩味物质合成相关的糖酵解途径、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸合成途径等.进一步研究发现,参与麻竹笋芳香族氨基酸、单宁合成的PFK、ENO、PPY-AT/HPP-AT、LAR等酶基因在EP处理中表达量下降,荧光定量PCR验证结果与测序结果基本一致.[结论]避光处理抑制了苯丙氨酸、酪氨酸、单宁生物合成关键酶基因的表达,可能最终影响麻竹笋苦涩味物质的合成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁兴萃	国家林业局竹子研究开发中心	22	151	8.0	11.0
2	蔡函江	国家林业局竹子研究开发中心	14	31	4.0	5.0
3	李露双	国家林业局竹子研究开发中心	2	5	2.0	2.0
4	董文慧	国家林业局竹子研究开发中心	1	2	1.0	1.0
5	章志远		2	2	1.0	1.0
6	孙春娃	国家林业局竹子研究开发中心	1	2	1.0	1.0