贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性位点生物信息学分析

• 作者: 兰青阔 刘娜 刘征辉 朱珠 汪小福 沈晓玲 王成 王永 赵新 陈笑芸 陈锐
• 来源期刊: 食品安全质量检测学报
• 关键词: 贝母 叶绿体基因组 单核苷酸多态性位点 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（17）
• 所属期刊栏目: 本期重点:第二届京津冀农产品质量安全青年论坛
• 页码范围: 4527-4533
• 页数: 7页
• 字数: 2780字
• 语种: 中文

摘要

目的 分析贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的分布特点、鉴别能力和应用价值,为中药材贝母精准鉴定方法的建立提供技术支撑.方法 应用多重序列比对、SNP筛选、酶切位点分析等生物信息学分析手段,对贝母属6种药用植物的15条叶绿体基因组序列进行分析.结果 贝母属叶绿体基因组DNA同源性达98.38％,通过分析共发现SNP位点4058个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,瓦布贝母鉴别候选位点个25个,太白贝母鉴别候选位点个120个,浙贝母鉴别候选位点个79个,湖北贝母鉴别候选位点个61个,平贝母鉴别候选位点794个.结论 叶绿体基因组SNP分子标记因其密度高、鉴别力强和便于分析的特点,具有较大的应用价值.