大豆GmANKTM家族非生物胁迫生物信息学分析

• 作者: 杨亚男 柏锡 王佳 王昕奕 郑佳佳 陈云 黄荣梅
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 ANKTM家族 生物信息学 非生物胁迫
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 18-27,39
• 页数: 11页
• 分类号: S565.1
• 字数: 3494字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2019.07.003

摘要

ANKTM(Ankyrin repeats transmembrane)蛋白属锚蛋白超家族,包含ANK基序和跨膜结构域,在非生物胁迫、生物胁迫、诱发衰老中起重要作用.为了解大豆ANKTM(Ankyrin repeats transmembrane)家族成员及其胁迫响应规律,利用生物信息学和q-PCR方法研究大豆ANKTM家族成员.结果表明,从大豆中鉴定出62个ANKTM家族基因,分为5个亚家族.该家族编码蛋白含346～1039个氨基酸,分子质量为37.88～114.83 ku,等电点(pI)为4.46～9.61.分析蛋白结构域发现,GmANKTM家族含ANK基序和跨膜结构域,58个基因含PGG结构域,此外还含ACBP、SBP、DHHC、G-PCR等其他结构域.除ANK基序、跨膜结构域和PGG结构域外其他结构域主要集中在第5亚家族.其余亚家族结构域分布位置和数量相近.启动子区域顺式元件分析发现,GmANKTM家族基因含光响应元件、激素响应相关元件和逆境响应相关元件.组织分析发现GmANKTM家族第5亚家族组织表达量高于其他亚家族.利用大豆转录组数据库分析发现,GmANKTM家族基因受盐胁迫和干旱胁迫强烈诱导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柏锡	东北农业大学生命科学学院	80	891	15.0	26.0
2	王佳	东北农业大学生命科学学院	9	11	2.0	3.0
3	王昕奕	东北农业大学生命科学学院	4	2	1.0	1.0
4	陈云	东北农业大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
5	杨亚男	东北农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
6	黄荣梅	东北农业大学生命科学学院	2	4	1.0	2.0
7	郑佳佳	东北农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0