人类miRNA-613的靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 巢潇莺 蒋智渊 钟国强 黎珊珊
• 来源期刊: 中国临床新医学
• 学科: 医学
• 关键词: 微小RNA-613 人类 靶基因 生物信息学 心脏疾病
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 课题研究·论著
• 页码范围: 381-385
• 页数: 5页
• 分类号: R318.5
• 字数: 3335字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-3806.2019.04.07

摘要

目的 利用生物信息学技术分析及预测人类miRNA-613(hsa-miR-613)的靶基因及其可能参与的生物学过程,为更深入的研究微小RNA与心脏疾病的关系提供基础.方法 通过miRbase数据库和UCSC Genome Browser获取hsa-miR-613的序列及其染色体定位和物种间保守性等基本信息.应用miRDB、TargetScan、miRanda、DIANA-microT对hsa-miR-613进行靶基因预测取交集,合并miRTarbase数据库中已被实验证实的靶基因作为基因集,进行功能注释(GO分析)和pathway信号通路富集分析.结果 hsa-miR-613在物种间高度保守,其靶基因功能富集于血管发育、细胞增殖发育等生物学过程.靶基因存在于细胞各个组分,例如细胞质、细胞器、黏着斑等,其分子功能富集于蛋白结合和转录因子活性的调控等(P＜0.05).信号通路分析提示靶基因的信号通路显著富集于突触囊泡循环、剪接体、PI3K-Akt信号通路、mTOR信号通路、黏着斑等通路中,以及包括先天性心脏病的先天性疾病、心血管系统疾病的相关通路中(P＜0.05).结论 hsa-miR-613预测的靶基因富集于多个生物学过程,与心脏发育过程密切相关,为进一步研究提供了生物学基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟国强	广西医科大学第一附属医院心血管内科	98	426	11.0	15.0
2	蒋智渊	广西医科大学第一附属医院高血压科	15	48	4.0	6.0
3	巢潇莺	广西医科大学第一附属医院心血管内科	1	0	0.0	0.0
4	黎珊珊	广西医科大学第一附属医院心电诊断科	3	2	1.0	1.0