新型冠状病毒序列变异时空分析系统的设计与实现

• 作者: 徐德晨 李建勋 李杰 李鑫 谢康
• 来源期刊: 生物信息学
• 关键词: 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 时空变异分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 86-95
• 页数: 10页
• 字数: 5408字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/202004008

摘要

新型冠状病毒肺炎目前已进入全球大流行状态,多个国家出现疫情爆发.美国疾病管制局期刊《新兴传染病》发表的关于新型冠状病毒的最新研究结论显示,新型冠状病毒基本传染数R0的中位数高达5.7,这意味着在未来较长时间内新型冠状病毒可能会在人群中持续传播并发生变异.在这一背景下,如何监视病毒的变异,对于冠状病毒的研究和药物研发具有重要意义.本文基于来自GISAID的病毒基因组序列数据,设计和实现了新型冠状病毒变异时空分析系统.该系统可对来自不同国家和地区的新型冠状病毒序列数进行统计,对病毒序列在不同时间、不同空间内的变异情况进行分析和可视化,同时还支持不同序列之间的差异比对.该系统可为新型冠状病毒肺炎的研究和政府的疾病控制机构的决策提供支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李鑫	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院生物信息学研究中心	46	333	11.0	16.0
2	李杰	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院生物信息学研究中心	31	115	5.0	10.0
3	李建勋	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院生物信息学研究中心	1	0	0.0	0.0
4	谢康	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院生物信息学研究中心	1	0	0.0	0.0
5	徐德晨	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院生物信息学研究中心	1	0	0.0	0.0