猪TLR4基因SNP位点筛选及生物信息学分析

• 作者: 刘丽霞 朱乔峰 李之昂 王馨敏 秦雅晶 马越
• 来源期刊: 甘肃畜牧兽医
• 学科: 农学
• 关键词: TLR4 猪 SNP位点 蛋白质 氨基酸
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 61-64,73
• 页数: 5页
• 分类号: S828
• 字数: 2849字
• 语种: 中文

摘要

通过构建基因组DNA混合池对猪TLR4基因进行扩增和测序,并对其编码区的SNP位点进行筛选,运用生物信息学分析软件对猪TLR4基因的理化特性和编码蛋白质的二、三级结构进行预测.结果发现,在扩增的TLR4基因上没有发现SNP位点,猪TLR4基因片段一共编码118个氨基酸,其中缬氨酸(Val)最多,甲硫氨酸(Met)最少,编码产物不稳定指数大于40,说明编码产物具有不稳定性.编码蛋白质片段的亲水性平均值为0.385,说明该基因编码的蛋白质呈现疏水性,猪TLR4基因编码的蛋白质是一种不溶性蛋白质.研究结果为猪TLR4基因深入研究提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘丽霞	西北民族大学生命科学与工程学院	60	132	6.0	9.0
2	马越	西北民族大学生命科学与工程学院	2	0	0.0	0.0
3	王馨敏	西北民族大学生命科学与工程学院	2	0	0.0	0.0
4	朱乔峰	西北民族大学生命科学与工程学院	4	0	0.0	0.0
5	秦雅晶	西北民族大学生命科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
6	李之昂	西北民族大学生命科学与工程学院	1	0	0.0	0.0