兰属植物EST-SSR标记开发及应用

• 作者: 刘红 包建忠 单东方 孙叶 曹宏 赵国琦 陈秀兰 马辉
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 兰属植物 EST-SSR标记 遗传多样性 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 681-688
• 页数: 8页
• 分类号: S682
• 字数: 5760字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2020.03.021

摘要

本研究利用兰属植物杂交种转录组测序数据开发EST-SSR标记,分析标记的多态性及兰属种质的遗传多样性,为兰属植物种质资源的创新和分类研究提供参考.结果表明,转录组测序分析获得113780条Unigene,从中共识别到23709个SSR位点,SSR位点出现频率为20.84％.从设计的200对引物中筛选出20对具有多态性,并且扩增条带大小与预期相符的EST-SSR标记引物,对48份兰属种质材料进行PCR扩增,平均多态位点数为3.0,共检测到81.00个等位基因,平均每对引物检测到4.05个等位基因.观测杂合度平均值为0.3208,期望杂合度平均值为0.5070;Shannon's信息指数的变化范围为0.2338～1.4724,平均值为0.9321,多态信息含量为0.1103～0.6622.对4个参试兰属植物种群进行遗传多样性分析,春兰和大花蕙兰的F1杂交种群与大花蕙兰种群亲缘关系较近,与春兰种群的亲缘关系较远.聚类分析结果表明,遗传相似系数为0.72时,48份种质聚成7类,春兰和大花蕙兰的F1代杂交种群大多聚入第I类,春兰种群聚入第V类,第II类、第III类、第IV类、第VII类均为大花蕙兰种群.