桃YABBY转录因子家族的生物信息学分析

• 作者: 刘慧敏 刘金凤 韩继红
• 来源期刊: 山东农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 桃 YABBY 进化分析 转录因子
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 页码范围: 992-997
• 页数: 6页
• 分类号: S662.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2324.2020.06.002

摘要

为了解桃中YABBY家族的成员和特征,本研究基于桃(Prunus persica)最新基因组组装注释数据,首次通过生物信息学手段系统鉴定并分析了YABBY基因家族特征,包括染色体定位、蛋白特征、基因结构、进化关系、保守结构域、启动子区域顺式元件.结果显示:桃中含有6个YABBY基因,分布在5条染色体上,其推导蛋白序列较短,分子量较小.家族成员含有4～6个内含子,结构较为复杂.桃中YABBY基因含有植物YABBY家族所有5个亚类,即CRC、INO、FIL/YAB3、YAB2和YAB5,且均含有保守的锌指结构和YABBY结构域.除了核心启动元件,桃YABBY基因还含有大量光应答、激素响应等顺式作用元件,表明该家族基因的表达可能会受到环境、激素等的影响.本研究初步研究了桃基因组中YABBY基因家族的特征,为后期该基因家族在桃中的功能验证提供了理论支撑.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩继红		2	2	1.0	1.0
2	刘金凤		1	0	0.0	0.0
3	刘慧敏		1	0	0.0	0.0