茉莉酸甲酯诱导下远志幼苗转录组分析及三萜类生物合成途径关键酶基因挖掘

• 作者: 孙静 张岗 张明英 彭亮 李依民 杨冰月 沈霞 胡本祥 陈莹 颜永刚 高静
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 远志 转录组 茉莉酸甲酯 三萜类 Unigene
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 2517-2529
• 页数: 13页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.09.029

摘要

目的 获得远志Polygala tenuifolia响应茉莉酸甲酯(methyljasmonate,MeJA)处理的转录组学信息,挖掘远志三萜类化合物骨架生物合成的关键酶基因.方法 以生长30d的远志组培苗为材料,分别用无菌水(CK)、50 μmol/L MeJA、100 μmol/L MeJA处理24 h,采用Illunima HiseqTM 2000 150PE进行转录组测序,使用Trinity软件完成Unigene的de novo拼接,基于BLAST实现Unigene的分类、功能注释、代谢通路分析、蛋白功能注释、差异基因分析和筛选等.结果 最终获得52.19 Gb数据,通过de novo拼接注释得到Unigene 54 426条,平均长度为1 604 bp,注释成功率100％.通过对MeJA处理前后基因进行差异分析,共筛选出差异基因3 390个,其中有1 287个上调,2 103个下调,且以100 μmol/L MeJA处理的差异基因总数及上调数最高.KEGG富集分析表明,差异基因主要富集于苯丙烷类生物合成、半胱氨酸与蛋氨酸代谢、淀粉蔗糖代谢、光合生物的固碳作用、萜类骨架生物合成等KEGG通路中.找到与远志三萜类骨架生物合成相关的基因59条,其中AACT、HMGS、HMGR、MK、PMK、MPD、DXS、IDI、FPPS、SQS、SE和β-AS受MeJA诱导后表达量上调.结论 对MeJA处理后的远志幼苗转录组进行分析,获得远志三萜类骨架生物合成相关的候选基因,MeJA可以诱导其三萜类骨架合成相关基因的表达,为远志的分子生物学研究提供了丰富的数据资源,也为后期开展远志三萜皂苷类化合物次生代谢途径解析奠定了基础.