基于分子模拟的离子交换层析中静电相互作用研究

• 作者: 姚善泾 林东强 梅乐和 沈立民
• 来源期刊: 生物加工过程
• 学科: 工学
• 关键词: 离子交换层析 静电相互作用 分子模拟 结合能 保留因子 平衡常数
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 研究与开发
• 页码范围: 29-32
• 页数: 4页
• 分类号: TQ028.3
• 字数: 2278字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3678.2006.02.006

摘要

将分子模拟方法引入到蛋白质离子交换层析中的静电相互作用研究.选用蛋清溶菌酶和牛胰凝乳蛋白酶为模型蛋白质,阳离子交换吸附剂SP Sepharose FF等为模型层析介质.从蛋白质数据库(PDB)中获得蛋白质三维结构数据,分析了介质孔径和配基分布,以点电荷模拟离子交换层析介质的功能配基,构筑了蛋白质-介质配基模拟表面体系.采用MCCE、Delphi和GRASP等程序包进行了分子模拟计算,考察了作用方向、作用距离、盐浓度、pH等对蛋白质和模拟配基平面间静电相互作用的影响.结果表明,宏观的层析平衡常数与微观分子模拟计算的相互作用能量参数间存在良好的线性关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚善泾	浙江大学化学工程与生物工程学系	224	2284	23.0	34.0
2	梅乐和	浙江大学化学工程与生物工程学系	61	1024	17.0	30.0
3	林东强	浙江大学化学工程与生物工程学系	54	541	13.0	20.0
4	沈立民	浙江大学化学工程与生物工程学系	1	5	1.0	1.0