6株猪O型口蹄疫病毒VP1基因的克隆与序列分析

• 作者: 娄高明 张念祖 张晋川
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 口蹄疫病毒 VP1基因 遗传发生树 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 72-76
• 页数: 5页
• 分类号: S852.6
• 字数: 2891字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.2006.01.020

摘要

根据口蹄疫病毒(FMDV)VP1基因的序列,设计并合成了2对用于扩增VP1基因的引物.从组织中提取总RNA,首先用P1、P2引物对6株猪O型口蹄疫病毒进行RT-PCR扩增,获得1 000bp的片段;再用p3、P4引物进行巢式PCR扩增,结果获得850 bp的片段.将850 bp的片段克隆到pMD18-T载体中,通过PCR鉴定,将阳性重组质粒进行测序并分析.结果发现6株FMDV的核苷酸同源性为80.2%～99.4%,其推导的氨基酸序列同源性为86.9%～99.5%;构建遗传发生树,发现6株FMDV属于两个不同的基因型,其中的Shunde00、Sihui01、Shenzhen99、Fushan01株属一个基因型(与Hongkong93、广东86分离株属同一基因型);Guangzhou99、Shenzhen00株属另一个基因型(与UKG-12-2001株、JPN2000株属同一基因型).通过对口蹄疫病毒VP1基因的测序与分析,了解其变异情况,为科学地防控FMD提供分子水平的依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张念祖		22	179	7.0	12.0
2	娄高明	韶关学院英东生物工程学院	24	134	7.0	10.0
3	张晋川	韶关学院英东生物工程学院	1	4	1.0	1.0