油菜EST资源的SSR信息分析

• 作者: 崔海瑞 张明龙 李小白
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 油菜 EST SSR 频率 特性
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种与品种资源
• 页码范围: 20-25
• 页数: 6页
• 分类号: Q37|S565.4
• 字数: 3777字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1007-9084.2007.01.004

摘要

从NCBI公共数据库获得63 334条油菜EST,通过前处理得到全长为12 165.38kb的无冗余EST 17 987 条.在这些序列中搜索出2 803个SSR,分布于2 443条EST中,出现频率是15.58%.这些EST-SSR的平均长度为18.84bp,平均分布频率是1/4.34kb.二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的类型,二者出现的频率基本相近,占总SSR的89.05%.AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复的84.04%和35.71%,同时对这些SSR的可用性进行了评价.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李小白	浙江大学原子核农业科学研究所	7	271	6.0	7.0
2	张明龙	浙江大学原子核农业科学研究所	20	445	11.0	20.0
3	崔海瑞	浙江大学原子核农业科学研究所	61	2119	27.0	45.0