禽腺病毒1型和4型六邻体蛋白抗原表位和密码子偏爱性分析

• 作者: 刘加波 庞耀珊 文艳玲 童桂香 董建宝 谢丽基 谢芝勋 邓显文 黄琦
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 禽腺病毒1型和4型 抗原表位 同义密码子 偏爱性
• 年，卷（期）: 2007,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 17-20
• 页数: 4页
• 分类号: S852.659.1
• 字数: 2631字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2007.11.005

摘要

为了研究禽腺病毒1型和4型(AAV-1和AAV-4)六邻体抗原表位和同义密码子的使用情况,运用生物学软件Antheprot 5.0和EMBOSS的CHIPS、CUSP程序分别对AAV-1和AAV-4六邻体进行了分析,并将分析结果与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较.结果显示,AAV-1、AAV-4六邻体的抗原表位区都主要集中在前段、中段,推测具有型和群特异性表位,可作为诊断型和群的首选蛋白.AAV-1和AAV-4六邻体的Enc值分别为43.553和38.475,在编码密码子使用频率上都存在明显差异,与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性也不同,其表达系统选择大肠埃希菌较为合适.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘加波		118	1407	21.0	29.0
2	谢芝勋		139	1616	23.0	31.0
3	庞耀珊		118	1412	21.0	30.0
4	邓显文		118	1428	21.0	30.0
5	谢丽基		73	730	16.0	23.0
6	董建宝		8	115	5.0	8.0
7	文艳玲	广西大学动物科技学院	5	105	4.0	5.0
8	黄琦	广西大学动物科技学院	11	59	3.0	7.0
9	童桂香	广西大学动物科技学院	3	61	3.0	3.0