黄瓜EST-SSR位点信息

• 作者: 李建吾 胡建斌
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 EST-SSR 位点信息
• 年，卷（期）: 2008,（11）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 58-60,68
• 页数: 4页
• 分类号: S642.2
• 字数: 3378字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8581.2008.11.018

摘要

从NCBI网站下载6344条黄瓜EST,通过前处理得到全长为2.91×106 bp的无冗余EST 6033条.利用SSRHunter软件从这些序列中搜寻到729个SSR,分布于667条EST中,出现频率为12.08%,分布频率为1/3.99 kb.单、二和三核苷酸重复是主导类型,三者共占总数的89.71%.A/T、AG/CT和AAG/CTT分别是单、二和三核苷酸的优势重复基元,分别占总数的29.77%、21.12%和14.95%.黄瓜EST-SSR以4～10次重复为主,基序长度主要集中于12～20 bp.最后对这些EST-SSR的多态性潜能进行了评价.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李建吾	河南农业大学林学园艺学院	44	442	12.0	19.0
2	胡建斌	河南农业大学林学园艺学院	59	510	12.0	20.0