一株氯氰菊酯降解菌16S rDNA,gyrB和GyrB的系统发育分析

• 作者: 张久刚 闫艳春
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 地球科学
• 关键词: 氯氰菊酯 生物降解 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 55-58
• 页数: 4页
• 分类号: X7
• 字数: 767字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2008.02.003

摘要

从农药厂污水处理池中分离得到一株氯氰菊酯降解菌,在30℃,pH 7.0的条件下,无机盐培养基中100mg/L的氯氰菊酯,经过7.5天,能够降解大约52.3%,外加碳源能够明显提高其降解性能.生理生化实验结合16S rDNA,gyrB和GyrB的系统发育分析,将其归为Gordonia菌属.在16S rDNA水平上,其与G.amicalis DSM44461和G.hydrophobica DSM44015<'T>的相似值最高,为98.1%;而在gyrB和GyrB水平上,其与G.hydrophobica JCM10086的相似值最高,分别为86.8%和91.1%.通过对所构建的系统发育树进行评估,表明16S rDNA序列适用于将分离菌株鉴定到属的水平上,而gyrB和GyrB更适用于在属内种的水平上进行系统发育的分析.