16S与gyrB基因联合建树快速鉴定一株解淀粉芽胞杆菌

• 作者: 傅奇 冯亚栋 林俊杰 肖玉娟
• 来源期刊: 食品与发酵工业
• 关键词: 16S gyrB 进化树 鉴定 解淀粉芽胞杆菌
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 116-120
• 页数: 5页
• 字数: 2551字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.023253

摘要

在保守序列高度相似的细菌鉴定中,单独使用16S rDNA/RNA序列进行比对和构建进化树通常无法准确鉴定到种,需要增加测序基因数并对多基因进行分析.为实现快速鉴定,课题组对16S与gyrB基因联合建树的方法进行了研究,将土壤中筛选的1株具有淀粉水解酶活性的杆菌HX2016004,分别用通用引物扩增16S和gyrB基因并测序,在Genbank进行序列比对后,选择各菌种保藏中心具有相似16S和gyrB基因的菌株,取其16S和gyrB基因序列,采用Paup*4.0构建进化树.使用16S与gyrB拼接序列构建的进化树中属于同一种的菌株聚合在1枝,分类结构准确,其中HX2016004与解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)聚合在1枝,鉴定为解淀粉芽胞杆菌.经生理生化试验验证,该菌株与解淀粉芽胞杆菌特征完全一致,使用16S和gyrB基因联合建树得到的鉴定结果准确且快速简便.通过对Genbank和EZBiocloud已知序列菌株的分析,16S和gyrB基因联合建树的方法普遍适用于解淀粉芽胞杆菌的鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	傅奇		12	6	1.0	2.0
2	肖玉娟		11	7	2.0	2.0
3	林俊杰		2	0	0.0	0.0
4	冯亚栋		1	0	0.0	0.0