参数序列比对算法研究

• 作者: 张涛涛 邹权 郭茂祖
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 参数序列比对 多边形分解 牛顿射线搜索算法 参数空间
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 65-67,84
• 页数: 4页
• 分类号: Q1
• 字数: 4186字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2008.02.006

摘要

序列比对是生物信息学中的一项重要任务,通过序列比对可以发现生物序列中的功能、结构和进化的信息.序列比对结果的生物学意义与所选择的匹配、不匹配、插入和删除以及空隙的罚分函数密切相关.现介绍一种参数序列比对方法,该方法把最佳比对作为权值和罚分的函数,可以系统地得到参数的选择对最佳比对结果的影响.然后将其应用于RNA序列比对,分析不同的参数选择对序列比对结果的影响.最后指出参数序列比对算法的应用以及未来的发展方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭茂祖	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	77	1227	20.0	33.0
2	邹权	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	7	125	4.0	7.0
3	张涛涛	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	3	77	3.0	3.0