鲤鱼肝胰脏cDNA文库的表达序列标签分析及Lb-Fabp mRNA的特征

• 作者: 刘黎黎 李文笙 林浩然 陈文波
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲤鱼 cDNA文库 表达序列标签 脂肪酸结合蛋白 mRNA表达
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 页码范围: 376-384
• 页数: 9页
• 分类号: Q785
• 字数: 1418字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.0000.2009.30376

摘要

本文构建了鲤鱼肝胰脏cDNA文库,共获得了1016条有效的表达序列标签.拼接组装成115个contigs和282个single-tons.其中215个拼接序列在GenBank公共数据库中寻找到相对应的基因.对它们进行功能性分类和比较分析为鲤鱼肝胰脏的研究提供了基因表达信息的基础.文库中1016条表达序列标签有11条代表了鲤鱼肝基本型脂肪酸结合蛋白(Lb-FABP).通过序列比较我们获得了两个具有相同开放阅读框长度的Lb-Fabp cDNAs.开放阅读框全长381bp,编码126个氨基酸.半定量RT-PCR结合Southern blot技术研究了L6-Fabp mRNA在成鱼不同组织以及早期发育不同时期的表达图式.结果表明,Lb-FabP mRNA在肝胰脏、中肠和后肠中表达量较高.同时在精巢和皮肤中有低水平的表达.脑、肌肉、卵巢、肾脏、脾脏、鳃和心脏等组织中其表达量更低.而在脂肪和前肠中则没有检测到Lb-Fabp mRNA表达.Lb-Fabp mRNA最早在胚体形成期检测到有低水平表达,随后的发育阶段中表达量逐渐升高.鲤鱼Lb-Fabp基因的表达图式提示在肝脏和肠等器官开始发育后,它可能在脂肪代谢中具有重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李文笙	中山大学生命科学学院水生经济动物研究所有害生物控制和资源利用国家重点实验室	18	186	8.0	13.0
2	林浩然	中山大学生命科学学院水生经济动物研究所有害生物控制和资源利用国家重点实验室	103	1848	23.0	38.0
3	陈文波	中山大学生命科学学院水生经济动物研究所有害生物控制和资源利用国家重点实验室	4	26	2.0	4.0
4	刘黎黎	中山大学生命科学学院水生经济动物研究所有害生物控制和资源利用国家重点实验室	1	9	1.0	1.0