基于Z曲线的新城疫病毒基因组生物信息分析

• 作者: 刘文博 刘秀梵 张小荣 曹永忠 顾敏
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 新城疫病毒 基因组 Z曲线 分子进化
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 页码范围: 30-33
• 页数: 4页
• 分类号: Q786
• 字数: 2888字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.01.007

摘要

Z曲线是DNA序列信息的一种几何学表示形式.利用Z曲线坐标所对应的生物学含义,可以对DNA序列的生物信息进行系统分析.本文对40株自测序和从GenBank下载的新城疫病毒(NDV)全基因组序列,利用网络提供和自开发的Z曲线分析系统,对NDV生物信息进行了比较分析,构建了NDV全基因组的X、Y、Z分量沿序列的分布曲线和三维Z曲线,比较了不同基因型NDV基因组Z曲线的特征.结果显示,在NDV全基因组中A、G碱基或A、C碱基是占优势的,在基因组的前1/3序列中,G、C含量大于A、T的含量.不同基因型NDV全基因组的Z曲线(从ClassI到ClassII的I-VIII型)有向Z轴靠拢的趋势.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张小荣	扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室	73	540	14.0	20.0
2	刘秀梵	扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室	373	3732	28.0	39.0
3	刘文博	扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室	67	568	14.0	21.0
4	曹永忠	扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室	39	133	7.0	9.0
5	顾敏	扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室	25	80	6.0	8.0