Unix下EST数据库本地化更新及序列预处理分析

• 作者: 刘尊良 宋东光 张辉松 黄林旋
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 工学
• 关键词: EST MySQL数据库 更新 预处理分析
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 页码范围: 52-56
• 页数: 5页
• 分类号: TP392|Q343.1
• 字数: 1480字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.01.012

摘要

利用FreeBSD操作系统的文本过滤命令将NCBI的Genbank数据库的EST序列实现本地化导入到MySQL数据库中并能够进行更新,这利于对不同物种不同组织器官基因表达的分析.以水稻EST数据为例,对EST序列两端出现的polyA/T和载体序列亦进行了鉴别及去除,经过预处理的EST序列数据将为进一步进行EST聚类及基因表达分析提供可靠的保证.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋东光	佛山科学技术学院园艺系	9	41	4.0	6.0
2	张辉松	佛山科学技术学院园艺系	3	16	2.0	3.0
3	黄林旋	佛山科学技术学院园艺系	2	7	1.0	2.0
4	刘尊良	佛山科学技术学院园艺系	1	1	1.0	1.0