人类基因组上CpG岛的定位和系统分析

• 作者: 屠鞠传礼 王建军
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: CpG岛 进化保守分析 CpG岛起源 转座子
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 254-257,262
• 分类号: Q811.4|Q62H30|Q92BO5
• 字数: 4135字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.03.017

摘要

为了研究CpG岛产生和消失机制以及位于基因启动子区域外的CpG岛保守性等问题,我们通过序列比对和进化保守性分析等方法,分析在人类和小鼠中保守的基因上的CpG岛.结果显示已有保守序列的突变以及序列插入删除是CpG岛产生和消失的主要原因,进一步分析发现52%的在小鼠基因组上保守序列完全缺失的CpG岛位于两个转座子之间,提示转座子所介导的序列插入是CpG岛形成和消失的重要原因.人类基因组上在启动子区域外的CpG岛中约有79%为新产生的CpG岛,显著高于启动子区域内新产生的CpG岛比例 (41%).GO分析表明与这些CpG岛相关的部分基因与神经系统发育显著相关,提示新产生的CpG岛参与神经发育过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王建军	中国科学院微生物研究所	62	1540	18.0	38.0
2	屠鞠传礼	中国科学院北京基因组研究所	2	1	1.0	1.0