植物一个新box H/ACA snoRNA的鉴定及功能分析

• 作者: 徐玲 殷秋平 程加富 胡娜
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 box H/ACA snoRNA 分子进化 假尿嘧啶化 snoR206
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 页码范围: 7-11
• 页数: 5页
• 分类号: Q522
• 字数: 3332字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.01.002

摘要

通过生物信息学方法对拟南芥基因组序列进行搜索,发现两个新的非编码小分子RNA基因,分别命名为AthsnoR206a和AthsnoR206b.它们相距约170nt,位于蛋白质基因间隔区.MFOLD二级结构预测这两个RNA均具有典型的box H/ACA snoRNA"发夹-铰链-发夹-尾巴"结构,符合box H/ACA snoRNA的判定标准;两个RNA分子的反义序列一致,可以判定它们为同一基因的两个拷贝.分析预测snoR206的两段反义序列分别指导拟南芥rRNA小亚基U1717位点和大亚基U2181位点的假尿嘧啶化修饰.在其它13种包括单子叶植物和双子叶植物在内的植物搜索到14个snoR206同源分子,其中12个发现于表达序列标签中,表明该snoRNA在植物中表达且广泛存在.具有双功能的snoR206在人和酵母中的部分功能同源分子分别为U70和snR32,表明其祖先分子在进化过程中存在分子重组.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程加富	江西科技师范学院生命科学院	2	1	1.0	1.0
2	徐玲	江西科技师范学院生命科学院	23	116	5.0	10.0
3	胡娜	江西科技师范学院生命科学院	20	99	5.0	9.0
4	殷秋平	江西科技师范学院生命科学院	2	1	1.0	1.0