拟南芥中影响基因对胁迫响应模式的顺式元件的挖掘

• 作者: 吕德康 才华 朱延明 李勇 柏锡 王飞飞 纪巍
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 启动子 TAIR数据库 顺武元件
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 314-317,321
• 分类号: Q943
• 字数: 2990字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.04.11

摘要

启动子中关键元件的数量、碱基变化等影响着所调控基因的表达模式.本文基于TAIR数据库的基因组序列和表达谱数据,首先通过BLAST比对和表达模式相关性分析,在拟南芥基因组范围内获得一批启动子序列相似程度很高而下游基因表达模式相反的启动子对,进而借助于PLACE顺式元件库,运用PatSearch软件找到这些启动子对中所含顺式元件种类与数量,并通过Culster聚类,GeneDoc和ContigExpress软件分析,获得了15个能影响胁迫条件下基因表达模式的关键顺式元件,这一发现暗示了生物系统利用较少的调控元件构建稳健与复杂的转录调控系统的方式.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李勇	东北农业大学植物生物工程研究室	41	568	14.0	22.0
2	柏锡	东北农业大学植物生物工程研究室	80	891	15.0	26.0
3	才华	东北农业大学植物生物工程研究室	63	619	14.0	22.0
4	纪巍	东北农业大学植物生物工程研究室	44	518	13.0	21.0
5	朱延明	东北农业大学植物生物工程研究室	125	1696	22.0	34.0
6	吕德康	东北农业大学植物生物工程研究室	4	43	2.0	4.0
7	王飞飞	东北农业大学植物生物工程研究室	2	6	1.0	2.0